Desmond : Biomolecular System을위한 고성능 분자 동역학 시뮬레이션

과학적 및 제약 학적 관심의 많은 생물학적 현상은 시뮬레이션을 요구하는 계산적으로 시간 규모에 따라 발생합니다.

Relion은 저온전자현미경(Cryo-EM)을 위해 특별히 고안된 이미지 처리 소프트웨어 입니다. 저온 전자현미경 데이터의 단일 입자분석에 의해 거대 분자 구조의 정제를 위해 만들어진 독립형 프로그램입니다.

AMBER는 protein receptors 와 drug candidates , biocatalysis 사이의 상호작용을 시뮬레이션 하는데 사용되는 분자역학의 주요 응용 분야 입니다.

Materials Studio 상용 소프트웨어로  재료 과학 및 화학 분야의 연구자가 재료의 원자 및 분자 구조와 특성 및 동작의 관계를 예측하고 이해할 수 있도록 설계된 완벽한 모델링 및 시뮬레이션 환경을 제공합니다.

Deep learning은 높은 수준의 데이터 표현을 배우기 위한 일련의 알고리즘 중 하나를 사용하는 Machine learning 방법의 일부 입니다.

LAMMPS is a classical molecular dynamics code and an acronym

(Large-scale Atomic Molecular Massively Parallel Simulator )

Gaussian은 다양한 화학적 환경에서 화합물과 반응의 에너지,분자구조,진동주파수 및 분자특성을 예측합니다.

VASP는 의사 전위 (pseudopotentials) 또는 프로젝터 - 증강 웨이브 방법과 평면 파동 (plane wave basis) 세트를 사용하여 ab-initio 양자 - 기계 분자 역학 (MD) 시뮬레이션을 수행하기 위한 복잡한 패키지입니다.

NAMD is parallel molecular dynamics code designed for HPC simulation of large biomolecular systems.

CHARMM  is a program for macromolecular simulations

Include energy minimization, molecular dynamics and Monte Carlo simulations

(Chemistry at Harvard Molecular Mechanics)

Fluent 상용소프트웨어는 가장 강력한 전산 유체 역학 (CFD) 도구로서 제품의 성능을 최적화 할 때 더욱 빠른 능률을 높여줍니다.

GROMACS는 분자동력학을 수행하는 다양한 패키지로 수백에서 수백만개의 입자가 있는 시스템에서 Newtonian equations식의 시뮬레이션을 합니다.

Openfoam은 CFD용 무료 오픈소스 소프트웨어 입니다.

XFdtd는 modeling 및 EM filed simulation을 위한 강력하고 혁신적인 도구를 엔지니어에게 제공하는 3D Electromagnetic simulation solver입니다.